當我的主管向我推銷博士學位時,這全是關於分析“大數據”的。我曾在濕實驗室生物學(主要是培養細胞)方面擁有BSc / MSc經驗,但是由於我一直並且一直非常擅長C語言編程和總體數據分析,因此我想涉足生物信息學。
我之所以選擇這個特定的博士,是因為我們的想法是我們從老鼠身上取出一個特定的組織,在同一個細胞池中進行各種不同的測定,然後進行分析,從而從數據中獲取更多信息通過巧妙地將數據整合在一起,沒有任何一種方法能夠告訴我們。無論如何,那是計劃。
實際上發生的事情是還沒有製定出將這種組織從小鼠體內取出的方案,沒有組織就沒有測序,沒有測序就沒有。沒有數據。因此,第一年,我不得不捲起袖子(象徵性地),並學習如何快速,輕鬆地殺死小鼠,以切除並純化測序所需的1個組織。再次,實際上,這不是那麼簡單。儘管您不需要/不需要德國/歐洲的許可來殺死一隻健康的老鼠並取出一些組織(只是以壓力方式殺死它,或者如果它是具有特殊表型的老鼠),但我還是覺得您理想情況下仍然應該教。不幸的是,儘管我實驗室中的其他博士/博士後都在研究小鼠,但當時我無法讓任何人教我,所以整個經歷非常痛苦。我先從籠子裡完全充滿二氧化碳,然後將老鼠放進去,而不是我現在知道你應該做的,那就是緩慢增加二氧化碳。這將永遠困擾著我。後來我學會了進行頸脫位,這對每個人都更好。
但是,在我能夠犧牲並提取所需的組織後,我開始被要求做越來越多的坦率怪誕的實驗。排出半意識小鼠的所有血液。植入電極。冷室實驗。我可以想到更多,但這並不適合在這裡使用。當然,所有這些都是法律及以上的知識-需要完成的重要科學-但是我個人無法繼續進行此類工作。這一切使我感到有點噁心,更重要的是,我討厭自己這樣做。最初需要20-40只鼠標才能獲得所需的數據,現在可能只有500-600只。也許更多。我停止計數了。
但是我現在面臨的現實是博士學位還有2年的去路了,我真的不會/不能再繼續24個月了。我已經向我的PI解釋了這種情況,但是他直截了當地告訴我-“這是您作為博士必須要做的事情”。有一次他說如果我不這樣做的話,那是可以的,但是“您將沒有足夠的數據來進行博士學位辯護。”
當然,這完全是胡說八道。我已經發布了數據,並且我現在大部分時間都在做數據分析,而且進展順利。我也將很快發布一些工具。問題是,如果我停止殺死老鼠,那麼我的老闆將在接下來的兩年中使我真正痛苦不堪-最終結果甚至可能是我被要求停止從事博士學位的工作。我不確切地知道如何或通過什麼機制來獲得博士學位,但是我的老闆/ PI顯然比我高得多,他每個月都會付錢給我(他讓我想起每個月),並且我們倆都知道如果我不殺死老鼠,還必須要殺其他人。 出於對德國博士學位制度的尊重,我應該指出,我的主管不是德國人,而且我相信另一位主管會以不同的方式處理該問題。雖然我不確定這是一個孤立的案例,但我認為在這種情況下,研究所(或附屬大學)沒有什麼可以做得更好/與眾不同的。
老實說,帶回家的信息對我來說,我希望我能早點問這個問題,早些收到所有令人鼓舞和鼓勵的話,然後也許我會有勇氣做正確的事,然後再變得困難。非常感謝大家!